انطلاقاً من رسالة وفلسفة الجامعة الإسلامية فإن قسم العلاج الطبيعي يسعى لتخريج أخصائيي علاج طبيعي على قدرٍ عالٍ من الكفاءة قادرين على القيام بواجباتهم بشكل مهني وذلك من أجل تقديم خدمات متميزة في هذا المجال، ومن خلال تطوير الكادر الأكاديمي والبحثي والتطبيقي كذلك سيسعى القسم للوصول إلى التميز ومواكبة التطور العلمي الهائل وتقديم خدمات استشارية والمساهمة المباشرة وغير المباشرة في خدمة المجتمع الفلسطيني.